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分析服務

轉錄組學

檢測概述

轉錄組廣義上指在相同環境（或生理條件）下的在一個細胞、或一群細胞中所能轉錄出的所有RNA的總和，包括信使RNA（mRNA）、核糖體RNA（rRNA）、轉運RNA（tRNA）及非編碼RNA；狹義上則指細胞所能轉錄出的所有信使RNA（mRNA）。

真核有參轉錄組測序（RNA-seq）采用Illumina測序平臺，對真核生物特定組織或細胞在某個特定狀態下轉錄的所有mRNA進行測序，與參考基因組比對，既可全面快速分析mRNA序列和豐度信息、又可對基因結構和產生的新轉錄本進行分析。

真核無參轉錄組測序（RNA-seq）采用Illumina測序平臺，對真核生物特定組織或細胞在某個特定狀態下轉錄的所有mRNA進行測序，拼接出最長的轉錄本為unigene，以unigene為參考序列進行后續分析，為研究無參考基因組物種的轉錄水平變化提供有力的技術手段。

原核轉錄組測序是基于Illumina測序平臺，構建鏈特異性文庫，研究原核生物在某個時期或者在某種環境條件下轉錄出來的所有mRNA

真核轉錄技術路線：材料選取——RNA提取——mRNA捕獲——文庫構建——上機測序

原核轉錄技術路線：材料選取——RNA提取——去rRNA建庫——上機測序

?轉錄組研究的意義

從整體水平上研究基因功能以及結構，以揭示特定生物學過程以及疾病發生過程中的分子機理。目前，轉錄組學已廣泛應用在表型和生理功能分析、臨床診斷及治療等領域

©尋找研究對象重要性狀或表型的biomarker或關鍵調控基因，如水稻抗倒伏、高產基因等;

©尋找研究對象時序性變化的主控因素，如小鼠胚胎發育過程等；

©尋找研究對象醫學上的作用機制，如致病菌的作用機理，藥物對病原菌的藥用機理等；

?主要產品

真核轉錄組測序（有參/無參）；原核轉錄組測序；小RNA測序；LncRNA測序；circRNA測序；全轉錄組測序

?轉錄組測序平臺

HiSeq 4000 System

NovaSeq 6000

?應用領域

作物抗逆機制解析、病原-宿主互作、土壤養分循環調控

?樣本要求
1）樣品類型：去蛋白并進行DNase 處理后的完整總RNA；
2）樣品需求量：≥2 μg；
3）樣品濃度：人、大鼠、小鼠樣品：≥65 ng/μL；其它類型樣品：≥100 ng/μL
4）樣品純度：OD 260/280=1.8~2.2；OD 260/230=1.8~2.2；動物樣品RIN≥7.0，植物樣品RIN≥6.5，28S:18S≥1.2。
?項目周期
常規項目周期為30工作日

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